Seznam typů RNA popisuje přirozeně se vyskytujicí typy RNA.
Regulační RNA
Typ |
Zkratka |
Funkce |
Výskyt |
Reference
|
antisense RNA |
aRNA |
Atenuace transkripce, degradace mRNA, stabilizace mRNA, blokování translace
|
Všechny organismy |
[12][13]
|
přirozené siRNA působící v cis
|
cis-NATs |
regulace genové exprese |
|
|
CRISPR RNA |
|
Štěpení cizorodé DNA |
Bakterie a Archea
|
[14] |
dlouhá nekódující RNA |
lncRNA |
Různé |
Eukaryota |
|
MikroRNA |
miRNA |
Regulace genové exprese |
Většina eukaryot |
[15] |
RNA interagující s PIWI
|
piRNA |
Obrana proti transpozonům, možná další |
Většina živočichů (Metazoa) |
[16][17]
|
malá interferující RNA |
siRNA |
Regulace genové exprese |
Většina eukaryot
|
[18] |
siRNA působící v trans
|
ta-siRNA |
Regulace genové exprese |
Vyšší rostliny |
[15] |
siRNA asociovaná s repeticemi |
rasiRNA |
Typ piRNA; obrana před transposony
|
Drosophila |
[19] |
7SK RNA |
7SK |
negativní regulace komplexu CDK9/cyklin T
|
|
|
Další RNA
Typ |
Zkratka |
Funkce |
Výskyt |
Reference
|
Vault RNA |
vRNA |
Pravděpodobně odstranění xenobiotik
|
|
[22] |
Reference
V tomto článku byl použit překlad textu z článku List of RNAs na anglické Wikipedii.
-
↑ GRIBALDO, S.; BROCHIER-ARMANET, C. The origin and evolution of Archaea: a state of the art.. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. Jun 2006, roč. 361, čís. 1470, s. 1007–22. DOI 10.1098/rstb.2006.1841. PMID 16754611.
-
↑ GILLET, R.; FELDEN, B. Emerging views on tmRNA-mediated protein tagging and ribosome rescue.. Mol Microbiol. Nov 2001, roč. 42, čís. 4, s. 879–85. PMID 11737633.
-
↑ GUENEAU DE NOVOA, P.; WILLIAMS, KP. The tmRNA website: reductive evolution of tmRNA in plastids and other endosymbionts.. Nucleic Acids Res. Jan 2004, roč. 32, čís. Database issue, s. D104-8. DOI 10.1093/nar/gkh102. PMID 14681369.
-
↑ THORE, S.; MAYER, C.; SAUTER, C., et al. Crystal structures of the Pyrococcus abyssi Sm core and its complex with RNA. Common features of RNA binding in archaea and eukarya.. J Biol Chem. Jan 2003, roč. 278, čís. 2, s. 1239–47. DOI 10.1074/jbc.M207685200. PMID 12409299.
-
↑ KISS, T. Small nucleolar RNA-guided post-transcriptional modification of cellular RNAs.. EMBO J. Jul 2001, roč. 20, čís. 14, s. 3617–22. DOI 10.1093/emboj/20.14.3617. PMID 11447102.
-
↑ JONES, TA.; OTTO, W.; MARZ, M., et al. A survey of nematode SmY RNAs.. RNA Biol. Roč. 6, čís. 1, s. 5–8. PMID 19106623.
-
↑ ALFONZO, JD.; THIEMANN, O.; SIMPSON, L. The mechanism of U insertion/deletion RNA editing in kinetoplastid mitochondria.. Nucleic Acids Res. Oct 1997, roč. 25, čís. 19, s. 3751–9. PMID 9380494.
-
↑ PANNUCCI, JA.; HAAS, ES.; HALL, TA., et al. RNase P RNAs from some Archaea are catalytically active.. Proc Natl Acad Sci U S A. Jul 1999, roč. 96, čís. 14, s. 7803–8. PMID 10393902.
-
↑ WOODHAMS, MD.; STADLER, PF.; PENNY, D., et al. RNase MRP and the RNA processing cascade in the eukaryotic ancestor.. BMC Evol Biol. 2007, roč. 7 Suppl 1, s. S13. DOI 10.1186/1471-2148-7-S1-S13. PMID 17288571.
-
↑ PERREAULT, J.; PERREAULT, JP.; BOIRE, G. Ro-associated Y RNAs in metazoans: evolution and diversification.. Mol Biol Evol. Aug 2007, roč. 24, čís. 8, s. 1678–89. Dostupné online. DOI 10.1093/molbev/msm084. PMID 17470436.
-
↑ LUSTIG, AJ. Crisis intervention: the role of telomerase.. Proc Natl Acad Sci U S A. Mar 1999, roč. 96, čís. 7, s. 3339–41. PMID 10097039.
-
↑ BRANTL, S. Antisense-RNA regulation and RNA interference.. Biochim Biophys Acta. May 2002, roč. 1575, čís. 1–3, s. 15–25. PMID 12020814.
-
↑ BRANTL, S. Regulatory mechanisms employed by cis-encoded antisense RNAs.. Curr Opin Microbiol. Apr 2007, roč. 10, čís. 2, s. 102–9. DOI 10.1016/j.mib.2007.03.012. PMID 17387036.
-
↑ BROUNS, SJ.; JORE, MM.; LUNDGREN, M., et al. Small CRISPR RNAs guide antiviral defense in prokaryotes.. Science. Aug 2008, roč. 321, čís. 5891, s. 960–4. DOI 10.1126/science.1159689. PMID 18703739.
-
↑ a b LIN, SL.; MILLER, JD.; YING, SY. Intronic microRNA (miRNA).. J Biomed Biotechnol. 2006, roč. 2006, čís. 4, s. 26818. DOI 10.1155/JBB/2006/26818. PMID 17057362.
-
↑ Horwich MD, Li C Matranga C, Vagin V, Farley G, Wang P, Zamore PD. The Drosophila RNA methyltransferase, DmHen1, modifies germline piRNAs and single-stranded siRNAs in RISC. Current Biology. 2007, s. 1265–72. DOI 10.1016/j.cub.2007.06.030. PMID 17604629. (anglicky) Je zde použita šablona
{{Cite journal}}
označená jako k „pouze dočasnému použití“.
-
↑ Ghildiyal M, Zamore PD. Small silencing RNAs: an expanding universe. Nat. Rev. Genet.. February 2009, s. 94–108. DOI 10.1038/nrg2504. PMID 19148191. (anglicky) Je zde použita šablona
{{Cite journal}}
označená jako k „pouze dočasnému použití“.
-
↑ AHMAD, K.; HENIKOFF, S. Epigenetic consequences of nucleosome dynamics.. Cell. Nov 2002, roč. 111, čís. 3, s. 281–4. PMID 12419239.
-
↑ DESSET, S.; BUCHON, N.; MEIGNIN, C., et al. In Drosophila melanogaster the COM locus directs the somatic silencing of two retrotransposons through both Piwi-dependent and -independent pathways.. PLoS One. 2008, roč. 3, čís. 2, s. e1526. DOI 10.1371/journal.pone.0001526. PMID 18253480.
-
↑ BOEKE, JD. The unusual phylogenetic distribution of retrotransposons: a hypothesis.. Genome Res. Sep 2003, roč. 13, čís. 9, s. 1975–83. DOI 10.1101/gr.1392003. PMID 12952870.
-
↑ FLORES, R.; HERNÁNDEZ, C.; MARTÍNEZ DE ALBA, AE., et al. Viroids and viroid-host interactions.. Annu Rev Phytopathol. 2005, roč. 43, s. 117–39. Dostupné online. DOI 10.1146/annurev.phyto.43.040204.140243. PMID 16078879.
-
↑ GOPINATH, SC.; MATSUGAMI, A.; KATAHIRA, M., et al. Human vault-associated non-coding RNAs bind to mitoxantrone, a chemotherapeutic compound.. Nucleic Acids Res. 2005, roč. 33, čís. 15, s. 4874–81. DOI 10.1093/nar/gki809. PMID 16150923.
Zdroj
Poslední aktualizace obsahu: 2024-03-05 05:23:18
Zdroj: Wikipedia (autoři článku Seznam typů RNA)
Licence textu: CC-BY-SA-3.0 Unported
Tento článek byl automaticky přejat z Wikipedie. Na obrázcích nebyly provedeny žádné změny. Obrázky se zobrazují ve zmenšené velikosti (jako miniatury). Kliknutím na obrázek získáte další informace o autorovi a licenci. Byly změněny prvky designu, odstraněny některé odkazy specifické pro Wikipedii (např. odkazy na Editaci a nebo na neexistující hesla) a provedena optimalizace pro rychlé načítání.