Ústav molekulární biologie rostlin Gregora Mendela
| Ústav molekulární biologie rostlin Gregora Mendela | |
|---|---|
| Vznik | 2000 |
| Sídlo | Vídeň, Rakousko |
| Mateřská organizace | Rakouská akademie věd |
| Oficiální web | www |
| Některá data mohou pocházet z datové položky. | |
Ústav molekulární biologie rostlin Gregora Mendela (EN: Gregor Mendel Institute of Molecular Plant Biology, GMI) je výzkumný ústav ve Vídni. Byl založen v roce 2000 Rakouskou akademií věd (ÖAW) s cílem podporovat špičkový výzkum v oblasti molekulární biologie rostlin[1][2]. GMI zaměstnává přibližně 130 lidí. Jeho zakládajícím ředitelem byl Dieter Schweizer a současným vědeckým ředitelem je Magnus Nordborg[3][4]. Ústav je pojmenován po Gregoru Mendelovi, jenž je známý také jako "otec genetiky", a to jednak díky jeho vědecké práci a také skutečnosti, že v polovině 19. století studoval na Vídeňské univerzitě.
Výzkum
Na GMI se provádí výzkum mnoha aspektů molekulární biologie[5]. Patří mezi ně základní mechanismy epigenetiky[6], buněčná biologie[7], interakce rostlin a patogenů[8][9], vývojová biologie[10][11] a populační genetika[12][13].
Působí zde devět nezávislých výzkumných skupin[14] (k prosinci 2021), které vedou:
- Youssef Belkhadir: Signalizace rostlinných buněk na rozhraní růstu a obrany[15][9]
- Frédéric Berger: Architektura a funkce chromatinu[16][17]
- Yasin Dagdas: Autofagií zprostředkované mechanismy kontroly buněčné kvality u rostlin[18][7]
- Liam Dolan: Vývoj a evoluce suchozemských rostlin[19][11]
- Arturo Marí-Ordóñez: Mechanismy rozpoznávání a umlčování transpozonů u rostlin[20]
- Ortrun Mittelsten Scheid: Epigenetické změny v rostlinách[8][6]
- Magnus Nordborg: Populační genetika[5][4][13]
- Silvia Ramundo: Chloroplastová biogeneze a kontrola kvality proteinů[21][22]
- Kelly Swarts: Genomika stromových kroužků[23]
Vědecký poradní sbor
Vědecký poradní sbor (SAB) každoročně hodnotí výzkum na GMI. SAB se skládá z nezávislých mezinárodních odborníků. Jejich hlavním úkolem je poskytovat Rakouské akademii věd a vedení ústavu zpětnou vazbu o kvalitě vědecké práce.
Členové vědeckého poradního sboru[24] (k prosinci 2021):
- Leif Andersson, Katedra lékařské biochemie a mikrobiologie, Uppsalská univerzita (Švédsko).
- Niko Geldner, Oddělení molekulární biologie rostlin, Univerzita v Lausanne (Švýcarsko).
- Harmit Malik, Oddělení základních věd, Fred Hutchinson Cancer Research Center (USA).
- Cathie Martin, John Innes Centre (Spojené království)
- Karin Schumacher, buněčná biologie, Centrum pro studium organismů v Heidelbergu (Německo)
- Keiko Sugimoto, Centrum pro vědu o udržitelných zdrojích RIKEN (Japonsko)
- Susan Wessler, Katedra botaniky a rostlinných věd, University of California, Riverside (USA)
Vědecká infrastruktura
GMI sídlí spolu s dalšími výzkumnými ústavy ve vídeňském BioCentru (Vienna BioCenter) ve 3. vídeňském obvodu, v jehož areálu pracuje více než 2600 vědců z více než 70 zemí[25]. V tomto vídeňském BioCentru sídlí také Institut molekulární biotechnologie (Institute of Molecular Biotechnology, IMBA), Výzkumný ústav molekulární patologie (Research Institute of Molecular Pathology, IMP) a Max Perutz Labs Vienna – společný ústav Vídeňské univerzity a Lékařské univerzity ve Vídni.
Přítomné vědecké skupiny mohou rovněž využívat služeb specializovaných oddělení Vídeňského biocentra (Vienna BioCenter Core Facilities – VBCF), jako jsou vysokokapacitní fenotypizace rostlin a sekvenování nové generace.
Vědecká komunikace
GMI si rovněž klade za cíl přiblížit tematiku rostlin a rostlinného výzkumu široké veřejnosti. Za tímto účelem GMI vyvinulo kvízové mobilní hry na téma Rostliny ve Vídni (Botanic Quest, Naturdenkmäler Wien Quest) a také informační platformu pro děti (gmi4kids).
Reference
- ↑ GMI - Gregor Mendel Institute of Molecular Plant Biology | FFG. www.ffg.at [online]. [cit. 2022-02-22]. Dostupné online. (německy)
- ↑ Festveranstaltung: 10 Jahre Gregor-Mendel-Institut. OTS.at [online]. [cit. 2022-02-22]. Dostupné online. (německy)
- ↑ About the Gregor Mendel Institute. www.oeaw.ac.at [online]. [cit. 2022-02-22]. Dostupné v archivu pořízeném z originálu dne 2022-01-18.
- ↑ a b Magnus Nordborg neuer Direktor des GMI. OTS.at [online]. [cit. 2022-02-22]. Dostupné online. (německy)
- ↑ a b PROVART, Nicholas J.; ALONSO, Jose; ASSMANN, Sarah M. 50 years of Arabidopsis research: highlights and future directions. The New Phytologist. 2016-02, roč. 209, čís. 3, s. 921–944. PMID: 26465351. Dostupné online [cit. 2022-02-22]. ISSN 1469-8137. DOI 10.1111/nph.13687. PMID 26465351.
- ↑ a b PIKAARD, Craig S.; MITTELSTEN SCHEID, Ortrun. Epigenetic regulation in plants. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology. 2014-12-01, roč. 6, čís. 12, s. a019315. PMID: 25452385 PMCID: PMC4292151. Dostupné online [cit. 2022-02-22]. ISSN 1943-0264. DOI 10.1101/cshperspect.a019315. PMID 25452385.
- ↑ a b CLAVEL, Marion; DAGDAS, Yasin. Proteasome and selective autophagy: Brothers-in-arms for organelle quality control. Current Opinion in Plant Biology. 2021-10, roč. 63, s. 102106. PMID: 34487948. Dostupné online [cit. 2022-02-22]. ISSN 1879-0356. DOI 10.1016/j.pbi.2021.102106. PMID 34487948.
- ↑ a b BRADAMANTE, Gabriele; MITTELSTEN SCHEID, Ortrun; INCARBONE, Marco. Under siege: virus control in plant meristems and progeny. The Plant Cell. 2021-08-31, roč. 33, čís. 8, s. 2523–2537. PMID: 34015140 PMCID: PMC8408453. Dostupné online [cit. 2022-02-22]. ISSN 1532-298X. DOI 10.1093/plcell/koab140. PMID 34015140.
- ↑ a b PARYS, Katarzyna; COLAIANNI, Nicholas R.; LEE, Ho-Seok. Signatures of antagonistic pleiotropy in a bacterial flagellin epitope. Cell Host & Microbe. 2021-04-14, roč. 29, čís. 4, s. 620–634.e9. PMID: 33713601. Dostupné online [cit. 2022-02-22]. ISSN 1934-6069. DOI 10.1016/j.chom.2021.02.008. PMID 33713601.
- ↑ KAO, Ping; SCHON, Michael A.; MOSIOLEK, Magdalena. Gene expression variation in Arabidopsis embryos at single-nucleus resolution. Development (Cambridge, England). 2021-07-01, roč. 148, čís. 13, s. dev199589. PMID: 34142712 PMCID: PMC8276985. Dostupné online [cit. 2022-02-22]. ISSN 1477-9129. DOI 10.1242/dev.199589. PMID 34142712.
- ↑ a b HETHERINGTON, Alexander J.; BRIDSON, Siobhán L.; LEE JONES, Anna. An evidence-based 3D reconstruction of Asteroxylon mackiei, the most complex plant preserved from the Rhynie chert. eLife. 2021-08-24, roč. 10, s. e69447. PMID: 34425940 PMCID: PMC8384418. Dostupné online [cit. 2022-02-22]. ISSN 2050-084X. DOI 10.7554/eLife.69447. PMID 34425940.
- ↑ LEE, Cheng-Ruei; SVARDAL, Hannes; FARLOW, Ashley. On the post-glacial spread of human commensal Arabidopsis thaliana. Nature Communications. 2017-02-09, roč. 8, s. 14458. PMID: 28181519 PMCID: PMC5309843. Dostupné online [cit. 2022-02-22]. ISSN 2041-1723. DOI 10.1038/ncomms14458. PMID 28181519.
- ↑ a b BURNS, Robin; MANDÁKOVÁ, Terezie; GUNIS, Joanna. Gradual evolution of allopolyploidy in Arabidopsis suecica. Nature Ecology & Evolution. 2021-10, roč. 5, čís. 10, s. 1367–1381. PMID: 34413506 PMCID: PMC8484011. Dostupné online [cit. 2022-02-22]. ISSN 2397-334X. DOI 10.1038/s41559-021-01525-w. PMID 34413506.
- ↑ Research Groups. www.oeaw.ac.at [online]. [cit. 2022-02-22]. Dostupné online.
- ↑ Wiener Pflanzengenetiker: "Gute Forschung ist eine Frage der Mentalität". DER STANDARD [online]. [cit. 2022-02-22]. Dostupné online. (německy)
- ↑ MONTGOMERY, Sean A.; BERGER, Frédéric. The evolution of imprinting in plants: beyond the seed. Plant Reproduction. 2021-12, roč. 34, čís. 4, s. 373–383. PMID: 33914165 PMCID: PMC8566399. Dostupné online [cit. 2022-02-22]. ISSN 2194-7961. DOI 10.1007/s00497-021-00410-7. PMID 33914165.
- ↑ OSAKABE, Akihisa; JAMGE, Bhagyshree; AXELSSON, Elin. The chromatin remodeler DDM1 prevents transposon mobility through deposition of histone variant H2A.W. Nature Cell Biology. 2021-04, roč. 23, čís. 4, s. 391–400. PMID: 33833428. Dostupné online [cit. 2022-02-22]. ISSN 1476-4679. DOI 10.1038/s41556-021-00658-1. PMID 33833428.
- ↑ ANIENTO, Fernando; SÁNCHEZ DE MEDINA HERNÁNDEZ, Víctor; DAGDAS, Yasin. Molecular mechanisms of endomembrane trafficking in plants. The Plant Cell. 2022-01-20, roč. 34, čís. 1, s. 146–173. PMID: 34550393 PMCID: PMC8773984. Dostupné online [cit. 2022-02-22]. ISSN 1532-298X. DOI 10.1093/plcell/koab235. PMID 34550393.
- ↑ CHAMPION, Clement; LAMERS, Jasper; JONES, Victor Arnold Shivas. Microtubule associated protein WAVE DAMPENED2-LIKE (WDL) controls microtubule bundling and the stability of the site of tip-growth in Marchantia polymorpha rhizoids. PLoS genetics. 2021-06, roč. 17, čís. 6, s. e1009533. PMID: 34086675 PMCID: PMC8177534. Dostupné online [cit. 2022-02-22]. ISSN 1553-7404. DOI 10.1371/journal.pgen.1009533. PMID 34086675.
- ↑ OBERLIN, Stefan; RAJESWARAN, Rajendran; TRASSER, Marieke. Innate, translation-dependent silencing of an invasive transposon in Arabidopsis. EMBO reports. 2021-12-21, s. e53400. PMID: 34931432. Dostupné online [cit. 2022-02-22]. ISSN 1469-3178. DOI 10.15252/embr.202153400. PMID 34931432.
- ↑ ROCHAIX, Jean-David; SURZYCKI, Raymond; RAMUNDO, Silvia. Regulated Chloroplast Gene Expression in Chlamydomonas. Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2021, roč. 2317, s. 305–318. PMID: 34028778. Dostupné online [cit. 2022-02-22]. ISSN 1940-6029. DOI 10.1007/978-1-0716-1472-3_18. PMID 34028778.
- ↑ PERLAZA, Karina; TOUTKOUSHIAN, Hannah; BOONE, Morgane. The Mars1 kinase confers photoprotection through signaling in the chloroplast unfolded protein response. eLife. 2019-10-15, roč. 8, s. e49577. PMID: 31612858 PMCID: PMC6794094. Dostupné online [cit. 2022-02-22]. ISSN 2050-084X. DOI 10.7554/eLife.49577. PMID 31612858.
- ↑ SWARTS, Kelly; BAUER, Eva; GLAUBITZ, Jeffrey C. Joint analysis of days to flowering reveals independent temperate adaptations in maize. Heredity. 2021-06, roč. 126, čís. 6, s. 929–941. PMID: 33888874 PMCID: PMC8178344. Dostupné online [cit. 2022-02-22]. ISSN 1365-2540. DOI 10.1038/s41437-021-00422-z. PMID 33888874.
- ↑ Scientific Advisory Board. www.oeaw.ac.at [online]. [cit. 2022-02-22]. Dostupné v archivu pořízeném z originálu dne 2022-01-19.
- ↑ About Vienna BioCenter. Vienna BioCenter [online]. [cit. 2022-02-22]. Dostupné online. (anglicky)
Externí odkazy
- GMI oficiální webové stránky
- Vídeňské biocentrum (Vienna BioCenter)
- Botanic Quest
- Přírodní památky Wien Quest (Naturdenkmäler Wien Quest)
- gmi4kids
- Výroční zpráva GMI 2021 (EN, PDF, 31,4 MB)
